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Tabelle 20. Kreuzreaktivität (∆C
unter Verwendung von DNA aus NSCLC FFPE-Zelllinien mit einem hohen
Aufgabebereich
Mutierte
Cut-off-
DNA
Wert
8
12ALA
6,6
12ASP
8
12ARG
8
12CYS
8
12SER
7,5
12VAL
7,5
13ASP
N. z.: Keine Kreuzreaktion.
* ∆C
-Werte von passenden Reaktionen.
T
∆C
-Werte von kreuzreaktiven Reaktionen unterhalb des Cut-off-Wertes.
†
T
Wiederholbarkeit und Reproduzierbarkeit
Ziel dieser Untersuchung war es, die laborinterne Präzision (Wiederholbarkeit)
sowie die laborübergreifende Präzision (Reproduzierbarkeit) des therascreen
KRAS RGQ PCR Kits zu belegen. Es wurde sowohl die Richtigkeit der Mutations-
bestimmungsergebnisse als auch die Präzision der ∆C
zwischen den C
-Werten einer Mutationsreaktion und der Kontrollreaktion)
T
ermittelt.
Kolorektalkarzinom
Für diese Bestimmung wurden klinische Kolorektalkarzinomproben verwendet.
Für jede Mutation wurden ein Wildtyp und eine Probe mit dem therascreen
KRAS RGQ PCR Kit getestet. Dabei kamen an jedem der 3 Standorte
2 Bediener zum Einsatz, die sowohl Proben als auch Kontrollen von 3 Chargen
des therascreen KRAS RGQ PCR Kits täglich über einen Zeitraum von 5 Tagen
testeten. Es wurden pro Tag 2 Testläufe und pro Probe und Tag jeweils
2 Replikate durchgeführt. Die für alle Reaktionen jeder Probe erhaltenen C
und ∆C
-Werte wurden darüber hinaus einer Varianzkomponentenanalyse
T
unterzogen.
therascreen KRAS RGQ PCR Kit Handbuch 01/2019
) zwischen den Mutationsreaktionen
T
12ALA
12ASP
12ARG
1,31*
12,8
N. z.
12,61
1,66*
N. z.
12,98
11,08
0,81*
N. z.
12,22
7,84
N. z.
12,87
13,21
14,29
N. z.
5,93
†
N. z.
N. z.
N. z.
∆C
Assay-
T
12CYS
12SER
5,01
2,26
†
†
N. z.
N. z.
11,24
N. z.
N. z.
0,56*
†
N. z.
1,93*
N. z.
13,14
N. z.
N. z.
-Werte (Differenz
T
12VAL
13ASP
5,57
12,65
†
10,3
12,60
12,66
12,62
13,06
11,84
13,25
12,93
12,39
0,45*
N. z.
2,02*
-
T
65
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